A partir de 1901, la comunidad judía de Poppelsdorf hizo construir una sinagoga nueva y más grande en la esquina de Bennauerstraße y Jagdweg, según los planos del arquitecto de Bonn Wilhelm Weinreis. Sustituyó a la sinagoga anterior, que se había instalado en una fábrica reconvertida en 1852.

El nuevo edificio, diseñado en estilo morisco, fue consagrado en mayo de 1902. En contraste con el aspecto exterior, el interior era de diseño sencillo. La sinagoga tenía capacidad para unos 100 hombres y unas 65 mujeres podían sentarse en la galería.

Al principio, los judíos de Poppelsdorf pertenecían a la comunidad de la sinagoga de Bonn. A partir de 1875, formaron una comunidad judía independiente, que incluía también a judíos de Dottendorf, Duisdorf, Ippendorf, Kessenich y, ocasionalmente, Endenich.

El 10 de noviembre de 1938, hombres de las SS derribaron la puerta e incendiaron la sinagoga. El edificio ardió hasta las paredes exteriores. Los bomberos no intervinieron, sino que se limitaron a proteger las casas vecinas. Las ruinas fueron demolidas en marzo de 1939. El lugar se utilizó entonces como vertedero.

Desde 1963, una lápida de granito en una pequeña zona verde recuerda la sinagoga destruida. En 1988, en el 50 aniversario del pogromo de noviembre de 1938, la lápida se completó con una menorá de piedra, un candelabro de siete brazos, uno de los símbolos religiosos más importantes del judaísmo.