С 1901 года еврейская община Поппельсдорфа построила новую, более просторную синагогу на углу Беннауэрштрассе и Ягдвег по планам боннского архитектора Вильгельма Вайнрайса. Она заменила предыдущую синагогу, которая была построена в переоборудованном здании фабрики в 1852 году.
Новое здание, выполненное в мавританском стиле, было освящено в мае 1902 года. В отличие от внешнего облика, интерьер был оформлен просто. Синагога вмещала около 100 мужчин; около 65 женщин могли разместиться на галерее.
Первоначально евреи Поппельсдорфа принадлежали к общине синагоги в Бонне. С 1875 года они образовали самостоятельную еврейскую общину, в которую также входили евреи из Доттендорфа, Дуйсдорфа, Иппендорфа, Кессениха и иногда Эндениха.
10 ноября 1938 года эсэсовцы выломали дверь и подожгли синагогу. Здание выгорело до внешних стен. Пожарная команда не вмешивалась, а лишь защищала соседние дома. Руины были снесены в марте 1939 года. После этого место использовалось как мусорный полигон.
С 1963 года в память о разрушенной синагоге на небольшой зеленой территории установлен гранитный памятный камень. К 50-й годовщине ноябрьского погрома 1938 года в 1988 году к памятному камню была добавлена каменная менора - семистворчатый канделябр, один из важнейших религиозных символов иудаизма.